एजी 101 (उन्नत पीढ़ी कैलेंडर का 101वां वर्ष) में एक रहस्यमय इकाई जिसे केवल "यूई" या "अज्ञात दुश्मन" के रूप में जाना जाता है, अंतरिक्ष कॉलोनी एंजेल पर हमला करती है और उसे नष्ट कर देती है। यह क्रूर हमला "द डे द एंजल फेल" के रूप में कुख्यात हो गया, और अस्तित्व के लिए मानवता के युद्ध की शुरुआत का प्रतीक है। श्रृंखला एजी 108 में शुरू होती है जब यूई अंतरिक्ष कॉलोनी ओवेन पर हमला करता है, जहां फ्लिट असुनो अब रहता है क्योंकि वह कॉलोनी के विनाश से पहले एंजेल से बच निकला था। यूई द्वारा मारे जाने से कुछ समय पहले फ्लिट की मां अपने बेटे को "एजीई डिवाइस" नामक एक वस्तु देती है। इसके भीतर वह अतीत के एक शक्तिशाली हथियार - "गुंडम" नामक प्राचीन मसीहा के ब्लूप्रिंट की खोज करता है।
इन ब्लूप्रिंट से, फ्लिट अगले कई साल नोरा अंतरिक्ष कॉलोनी में अर्थ फेडरेशन बेस पर इंजीनियरिंग का अध्ययन करने और गुंडम AGE-1 को डिजाइन करने में बिताता है। सात साल बाद, एजी 115 में, फ्लिट ने गुंडम एजीई-1 नॉर्मल को पूरा किया, जैसे यूई ने नोरा पर हमला किया, और इसका उपयोग कॉलोनी के नागरिकों को नष्ट होने से पहले निकालने में फेडरेशन के युद्धपोत "दिवा" के चालक दल की सहायता के लिए किया। अपने घर को दो बार नष्ट करने के लिए लड़ाई को यूई में लाने के लिए दृढ़ संकल्पित, फ्लिट गुंडम का संचालन करने वाले दिवा के मोबाइल सूट दस्ते में सेवा करने के लिए सहमत हो गया। कार्रवाई की दिशा स्थापित करने के लिए पर्याप्त डेटा और सैन्य शक्ति प्राप्त करने के बाद, दिवा के चालक दल और उनके सहयोगियों ने एक सफल हमला शुरू किया जिसने अंबत क्षुद्रग्रह में यूई के गुप्त किले को नष्ट कर दिया। वहां उन्हें पता चलता है कि यूई वास्तव में मंगल ग्रह पर उपनिवेश बनाने के लिए भेजे गए कथित रूप से विफल मानव मिशन के वंशज हैं, जिन्हें अर्थ फेडरेशन ने मृत समझकर छोड़ दिया था, जिन्होंने वेइगन नामक लाल ग्रह पर अपना राष्ट्र बनाया था।
