कोउकाकु किदुतई २

यह पहली घोस्ट इन द शैल मंगा के कुछ साल बाद घटित होता है। मेजर तब से लापता है, और घोस्ट इन द शैल 2 रहस्यमय मोटोको अरामाकी का अनुसरण करता है क्योंकि वह एक अंग कारखाने में एक घटना और उसके परिणामों की जांच चलाती है। वह गंदगी साफ़ करने और इस प्रक्रिया में खुद को बचाने के लिए भाग रही है। इस बीच, धारा 9 के पूर्व सदस्य मोटोको की जांच करते हैं ताकि यह पता लगाया जा सके कि वह वास्तव में कौन है।